黨中央、國務院相繼出臺《關于加快推進生態文明建設的意見》和《生態文明體制改革總體方案》等重要文件，就生態文明建設和環境保護工作做出了一系列重大決策部署，排污權有償使用和交易工作正式納入生態文明體制改革頂層設計。排污權交易作為一項創新工作，國內沒有明確的標準和統一的范例。各地在出臺規章制度時，往往因為沒有明確規定而被質疑。當前要推動排污權交易，還需要完善以下六大體系。
一是法律制度體系。要從法律上確定環境資源產權制度，確認排污權的資產屬性，明確排污權有償使用和市場交易的法律地位。要對排污權初始分配、有償使用、市場交易做出統一規定，明確各相關方的權利、義務和責任，對無證排污、超量排污等行為明確罰則。要鼓勵試點地區制定排污權有償使用、儲備交易、抵押貸款等配套管理辦法，開展地方立法探索。
二是分配核定體系。初始分配是排污權交易工作的前提和基礎。要明確區域總量控制目標和初始排污權分配方法，確定初始分配和有償取得的條件、程序、時限要求，建立排污權動態管理臺賬。要充分考慮排污情況的復雜性，以達標排放為前提，以現有產能為基礎，以區域總量為上限準確核算初始分配量，鼓勵企業結合實際自愿減少初始分配量，并充分兼顧不同企業、不同項目。要保持政策的連續穩定性，禁止無依據調整指標，禁止隨意限制富余指標上市交易。
三是價格標準體系。價格杠桿在市場經濟中具有導向作用甚至是決定性作用。一級市場體系中，排污權有償方式、有償標準、使用周期是界定環境資源產權的重要標準，也是試點工作難點。政府應當根據環境資源稀缺程度、社會經濟發展水平、企業承受能力和各區域實際情況等，統一制定有償使用收費標準和收費方式。試點初期，重在建立有償使用規則和資源產權意識，有償使用收費標準可以低價起步，逐步提高。
二級市場體系中的交易價格應該由市場決定，隨市場供求關系而波動。政府可以制定交易指導價。交易指導價應高于初始排污權有償使用價格，較大的價差可以激勵企業治污減排。
四是交易流通體系。健全完善的排污權交易市場應該具備以下特征：能夠讓市場規則發揮重要作用，使環境資源合理有序流轉；能夠讓價格杠桿發揮重要作用，切實降低全社會整體治理成本；能夠讓經濟政策發揮重要作用，切實保障排污單位的減排收益和減排動力。
五是宏觀調控體系。要切實發揮政府在排污權交易工作中的宏觀調控作用。做好政策引導，完善政策制度，創造公平的市場競爭環境。加強市場監管，嚴厲打擊投機取巧、市場壟斷、囤積居奇等行為，禁止濫用和非法轉讓排污指標，保障交易合法性。加強宏觀調控，不斷完善政府收儲投放制度。市場供過于求時，及時實施回購儲備；供不應求時，及時投放儲備指標。優先安排企業指標上市交易，政府不與企業爭利益。
六是執法監管體系。強有力的執法監管是交易機制運行的根本保障。要通過不斷完善污染源監測監控體系，加強信息公開和公眾監督，加大監管檢查和處罰力度，嚴把交易審批關和排污許可關。對無證排污、無權排污、超量排污等行為進行嚴厲處罰，切實提高違法成本，讓污染者付費原則真正發揮重要作用。
